Identification d’un variant émergent du SARS-CoV-2

Une nouvelle souche du SARS-CoV-2, désignée NB.1.8.1, a été repérée en France dans plusieurs échantillons positifs. Encore peu documenté, ce variant circule déjà dans différents pays. Bien que les autorités sanitaires se montrent vigilantes, aucun signal d’alerte élevé n’a été émis pour l’instant. Les premières analyses s’appuient sur le séquençage génomique pour évaluer sa diffusion.

Le variant identifié en France et premières données de séquençage

Le centre national de référence a signalé la présence de ce nouveau variant dans au moins quatre cas confirmés. Ces séquences ont été détectées à la fois dans des hôpitaux et dans des lieux de soins de ville.

Le repérage a été possible grâce au séquençage, une méthode utilisée pour analyser précisément la structure génétique du virus. Cette technique permet d’identifier des mutations, qu’elles soient connues ou inédites, et de surveiller leur apparition sur le territoire.

Le variant NB.1.8.1 s’ajoute aux nombreuses mutations observées depuis le début de la pandémie. Après les souches Alpha, Bêta, Gamma, puis le JN.1 détecté en juillet 2024, ce nouveau lignage génétique retient désormais l’attention.

Santé publique France rappelle que le séquençage joue un rôle essentiel pour repérer rapidement ces mutations et suivre leur trajectoire dans la population.

Une circulation mondiale et un niveau de vigilance modérés

D’autres pays ont signalé la présence du NB.1.8.1. Des cas ont été observés dans plusieurs régions des États-Unis, notamment aux aéroports de Virginie, de Californie, de Washington et de New York. D’après les données centralisées par GISAID, plusieurs nations sont concernées : le Japon, la Corée du Sud, le Vietnam, la Thaïlande, l’Espagne, les Pays-Bas, la Chine et Taïwan.

Le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) indique que cette souche ne figure pas parmi celles actuellement placées sous surveillance spécifique. Le Centre américain CDC adopte une position similaire.

En France, la vaccination est toutefois fortement recommandée pour les personnes à partir de 80 ans, les résidents en EHPAD et en unités de soins de longue durée et les immunodéprimés.

Pour rappel, l’injection n’est prise en charge qu’en partie. De ce fait, il convient de vérifier sa mutuelle santé pour être sûr d’être intégralement remboursé.

À retenir

• Un nouveau lignage viral du SARS-CoV-2 a été mis en évidence sur le territoire français, avec quelques cas confirmés par séquençage.
• D’autres pays ont également identifié cette souche, bien que son niveau de diffusion reste faible selon les données disponibles.
• Les autorités européennes et américaines n’ont pas encore classé ce variant parmi ceux nécessitant une surveillance renforcée.